Setelah mendapat gelar Master of Science dan gelar Doktor dari University of New Mexico, USA, serta pre dan post-doctor dari Columbia University di New York, Prof. Jatna mengawali karir sebagai dosen senior di Departemen Biologi Universitas Indonesia. Sepanjang karirnya, Prof. Jatna telah memimpin sejumlah organisasi antara lain Research Center for Climate Change (RCCC) Universitas Indonesia, Direktur Eksekutif/Vice President Conservation International Indonesia (1994-2011), Presiden South East Asia Primatologist Association (2006), Ketua IUCN-SSC PSG Asia Tenggara (2007), dan menjadi anggota aktif beberapa organisasi internasional seperti IUCN, International Primatological Society, dan sebagainya. Tahun 2011, beliau diangkat oleh Presiden Susilo Bambang Yudhoyono sebagai anggota Akademi Ilmu Pengetahuan Indonesia. Prof. Jatna menjalankan sejumlah penugasan untuk inisiatif tingkat nasional oleh Pemerintah Indonesia dan juga menjabat sebagai Pengawas dan Pembina untuk sejumlah lembaga non-profit bidang lingkungan. Beliau telah menerima sejumlah penghargaan bergengsi tingkat internasional untuk dedikasinya bagi konservasi dan lingkungan, serta kontribusinya dalam bidang penelitian di Indonesia, diantaranya Golden Ark Award (1999), Habibie Award (2008), Terry MacManus Award  (2010), Achmad Bakrie Awards (2011) dan Lifetime Achievement from Conservation International (2017). Beliau telah membuat lebih dari 20 buku mengenai lingkungan dan konservasi, serta lebih dari 150 paper bereputasi internasional.